Also wir reisen eigentlich immer nur mit dem Mietwagen, selbst in Japan, weil wir einfach keine Lust auf Bus und Bahn haben. Grundsätzlich ist das Fahren in Japan relativ leicht und auch gemächlich, aber Vorsicht, es gilt Linksverkehr!
Tokyo ist an und für sich auch einfach zu bewältigen und Parkplatzprobleme hat man in dem Sinne nur, wenn man ungern zu viel Geld für die vorhandenen Parkplätze zahlen möchte. Das einzige was dort zu beachten ist, sind die "Autobahnen/Hochbahnen", die gerne mal in mehreren Etagen übereinanderlaufen und das Navi gehörig durcheinanderbringen können. Verpasst man dann eine Ausfahrt kostet das dann gut und gerne 20-30 Minuten Umweg.
Ich würd in Japan immer wieder ein Auto mieten, außer man möchte wirklich nur in der Stadt verweilen oder nur Großstadthopping (z.B. Tokyo, Kyoto, Nara, Osaka und wieder zurück) betreiben, dann eher Zug als Auto, ganz klar. Wir sind ja wie in unserem Reisebericht ersichtlich, Anfang 2023 von Tokyo nach Fujikawaguchiko gefahren und es hat wirklich Spaß gemacht, allerdings gibt es hier auch noch zwei ganz wichtige Punkte:
1. Internationaler Führerschein wird nicht anerkannt, also müsst ihr euch frühzeitig um die Übersetzung kümmern, geht z.B. über den ADAC.
2. Mautgebühren! Wir haben zusätzlich zum Mietwagen für 1 Woche in Tokyo und umzu nochmal gut über 200 EUR nur für die Maut bezahlt, von den Parkgebühren ganz zu schweigen 
Nächstes Jahr planen wir ja auch wieder nach Japan zu fliegen und wollen dann auch von Tokyo wahrscheinlich Richtung Nagano fahren, also ich würds immer wieder so machen. Bei Fragen, keine Scheu 